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Para aquellos que dispongan de Beryl como gestor de ventanas por defecto o para intrépidos que ya usan la versión inestable de Compiz Fusion (Beryl+Compiz), lo normal es que tras un tiempo probando el gestor, os hayáis percatado de algún que otro bug visual. El fallo en concreto se reduce a una defectuosa visualización de las ventanas, es decir, las aplicaciones Java no congenian con Beryl, de manera que tengamos que editar un fichero de nuestro sistema Ubuntu. La información para subsanar el error la encontré en el blog de edgJavier, al que llegué después de indagar en la red durante semanas y en donde se esclarece que la solución procede de los foros oficiales de Ubuntu. Ahora bien, abrimos una terminal y escribimos lo siguiente:

<font color="#800000"><strong>sudo gedit /etc/environment</strong></font>

A continuación, añadir lo siguiente al final del fichero que se ha abierto para edición:

<strong><font color="#800000">AWT_TOOLKIT=&rdquo;MToolkit&rdquo;</font></strong>

Finalmente, sólo queda reiniciar el sistema para acabar con el problema de las aplicaciones Java.